مقدمة
نظام التسلسل 4000 للإلكترونيات الحيوية هو نظام تسلسل من الجيل التالي تم تطويره حيث يعتمد النظام تقنية تسلسل أشباه الموصلات.
ومن خلال العمل مع مجموعات الاختبار الإكلينيكية وبرامج تحليل البيانات وإدارتها التلقائية، يُعد هذا البرنامج مثاليًا للمختبرات الإكلينيكية.
معدل النقل التسلسلي متوسط
استنادًا إلى تقنية تسلسل شرائح أشباه الموصلات المبتكرة، يتم الحصول على تسلسل القاعدة عن طريق اكتشاف تغير الرقم الهيدروجيني (pH) الناتج عن تيار H + ion المتولد أثناء تضاعف DNA في الوقت الحقيقي. يمكن أن تنتج سلسلة طلقات الأشعة التي يتم اختيارها أنواعًا مختلفة من الشرائح، بيانات بسعة 10 غيغابايت إلى 60 غيغابايت، وهي مثالية لمختبرات التشخيص السريرية المستقلة.
تسلسل القراءة الطويلة
متوسط طول القراءة بالتسلسل حتى 200 بكسل، قادر على تسلسل طول الحمض النووي الخالي من خلايا البلازما بالكامل.
قابلية امتداد قوية
وبدون الحاجة إلى تغيير أجهزة مضيف الأداة، يمكنه إكمال تطبيق أطوال قراءة التسلسل المختلفة وتتدفق البيانات باستخدام الشرائح التسلسلية ذات التدفق المختلفة فقط
المنتج ذو الصلة:
الطراز | تسلسل إلكترونيات الأحياء 4000 |
تسلسل التدفق | شريحة PI: ≥ 10Gb؛ شريحة PII : ≥ 60 جيجا بايت |
تسلسل أطوال القراءة | شريحة بي آي: 200 قاعدة, شريحة بي آي: 100 قاعدة |
رقم التسلسل الفاعل | شريحة PI: ≥ 80 مليون؛ شريحة PII: ≥ 200 مليون |
وقت التسلسل | ساعتان ونصف |
حلول المكتبة الحالية | مجموعة مكتبة ion Ampliq™ مجموعة مكتبة الشظايا ion Xpress™ Plus مجموعة أدوات Exome الخاصة بـ ion TargetSeq™ مجموعة تسلسل RNA لإجمالي الأيون |
حلول تحليل البيانات | يتيح مستعرض Torrent للمستخدمين الوصول عن بُعد إلى حالة الأداة ومراقبة عملية التسلسل باستخدام اتصال الشبكة؛ التنوع من المكوّنات الإضافية لتحليل البيانات السريرية، يمكن أن تكمل البيانات السريرية المخصصة التحليل التلقائي السريع |
تنسيق البيانات | FASTQ وSFF وBAM وVCF إلخ. |
إمداد الغاز | الاتصال: 0.25 في ملحق الاتصال بمفتاح واحد الضغط: 30 رطلاً لكل بوصة مربعة التركيب: النيتروجين (الدرجة 4.8، 99.998% أو أفضل) |
اتصالات أخرى | Ethernet: 1 جيجا USB: منفذا USB 2.0 |
أجهزة كمبيوتر المعدات | المعالج: جسر ساندي مزدوج من Intel® Xeon® ذي 8 مراكز الذاكرة: ذاكرة وصول عشوائي (RAM) سعة 128 جيجابايت FPGA: Dual Altera® Stratix® V معالج وحدة معالجة الرسومات: 1x NVIDIA® Tesla® C2075 التخزين: 11 تيرابايت (محرك أقراص ذو حالة صلبة (SSD) ومحرك أقراص ثابتة (HDD) نظام التشغيل: Ubuntu® 11.10 |
التكوين القياسي | 1. مُسلسِل الجينات (تسلسل إلكتروني حيوي 4000) 2. خادم عالي الأداء 3. جهاز PCR تلقائي (Ion OneTouch 2) 4.ES جهاز تنقية الأحماض النووية للنحاس المغناطيسي (Ion OneTouch ES) 5. صمام التحكم الهوائي متعدد المراحل 6) جهاز الطرد المركزي للشريحة المتسلسل 7. دوار الطرد المركزي |
بيئة العمل (للاستخدام الداخلي فقط) | درجة الحرارة: 20 - 25 درجة مئوية (68 - 77 درجة فهرنهايت)؛ الرطوبة: 40 - 60%، بدون تكثف؛ الارتفاع: <6500 قدم (2000 م)؛ الخلوص: 12 بوصة (30.5 سم) بوصة خلفي؛ 10 سم (4 بوصات) على الجانب الأيسر؛ 10 سم (4 بوصات) على الجانب الأيمن؛ 10 سم (4 بوصات) من الحافة الأمامية للمقعد إلى إطار جهاز التسلسل؛ 90 بوصة (36 بوصة) سم) على مسافة في مقدمة المقعد للوصول إلى المشغل |
مصدر الطاقة | تيار متردد 220 فولت، 50/60 هرتز، 1100 فولت أمبير؛ تيار متردد 110 فولت، 60 هرتز(اختياري، محول خارجي) |
الأبعاد (العرض*العمق*الارتفاع) | 618*750*507 مم |
الوزن الصافي | 60 كجم |
حجم الحزمة (العرض*العمق*الارتفاع) | 1. مضيف جهاز التسلسل: 900*610* 590 مم 2. قطع: 1020* 860*920 مم 3. ion OneTouch ES: 460*350* 330 مم 4. ion OneTouch 2: 530*480*450 مم 5. تورنت أيوني رقاقة أيونية Minifuge؛ Ion Pronton الدوار؛ سلك؛ وهكذا دوّار: 670*460* 540 مم الإجمالي: 5 أجهزة كمبيوتر (3 علب كرتون+2 لوحات) |
الوزن الإجمالي | 1. مضيف جهاز التسلسل:60 كجم 2. قطع: 50 كجم 3. ion OneTouch ES: 8 كجم 4. ion OneTouch 2: 12 كجم 5. تورنت أيوني رقاقة أيونية Minifuge؛ Ion Pronton الدوار؛ سلك؛ وهكذا: 6 كجم |